Как нумеровать кассовые документы?

Добрый день! Подскажите, пожалуйста, как правильно организовать учет кассовых операции организации на УСН вид деятельности розничная торговля в магазинах. У нас несколько отделов которые работают в одной программе мне сдается выручка и соответственно я добавила др. наименование кассы в котором я оформляю ПКО и РКО по своей кассе, а нумерация с нарастающим итогом по всем отделам в целом по организации. По словам программиста с нумерацией  ПКО и РКО ничего сделать нельзя, а ведь нумерация в кассовой книге должна быть  последовательна и исправления в кассовые документы вносить нельзя?